shoorick

https://addons.mozilla.org/ru/thunderbird/addon/956/ — дополнение к тандербёрду, позволяющее удалять дубли сообщений писем (а вот KMail это может делать сразу, без плагинов). Автор пишет:

Doppelte Nachrichten im Postfach können mit diesem Add-On sehr schnell entfernt werden. Mit einem Rechtsklick auf einen Ordner und auswählen von "Doppelte Nachrichten entfernen..." werden auch Unterordner bereinigt.

Я проверил: на папке с тремя тысячами писем действительно sehr schnell, а вот папка, где лежит 57 тысяч писем (это я ещё, взяв imapfilter, оттуда стёр 200 тысяч), заставляет его серьёзно задуматься. Надо бы поискать консольный вариант.